Među osobama sa želučanim i crijevnim problemima značajno su češće migrene nego u ostatku populacije. Najnovija otkrića o tome potvrđuju vezu migrene sa sindromom iritabilnog crijeva, upalnim bolestima crijeva i celijakijom. Često pomaže dijeta bez glutena a čak i kod dojenčadi pronađeno je kako crijevne kolike mogu biti vezane sa glavoboljom. Trenutno se ispituje utjecaj prehrane bogate probiotičkim kulturama na sve spomenute simptome, a otkrića o kojima je riječ bacaju novo svjetlo na mehanizam kojim probavni sustav utječe na mnoge druge tjelesne funkcije i bolesti, uključujući kronične poput migrene.
